顶礼的第一步是将手掌放在心间，而不是头顶上，这表示对佛菩萨的恭敬；
第二步是将手掌放在头顶的发旋儿处，而不是额头上，此时观想向佛的身顶礼，清净自己的身业如杀盗等。
第三步放在喉间，观想向佛的语顶礼，清净自己的语业如妄语、粗语等。
第四步放在心口，观想向佛的心或智慧顶礼，清净自己的意业如贪嗔痴。
之后五体投地，即额头、双掌与双膝同时触地，观想向佛的身、口、语、功德、事业顶礼，清净自己极细微的障碍，有些人称此为磕短头。
如将身体伸直匍伏于地以五体顶礼，则称之为磕长头。当身体趴下去时，双手合掌置于头顶上，前面放置念珠记数，然后站起来。
顶礼主要是一种恭敬的表示，磕长短头都可以。虽说顶礼的方式有很多，但上面讲的两种在经书中有记载，所以是如法的。站起时身体要正直，不可弯腰驼背；合掌时手要合好。纵然加行的数量要做够，但质量更是重要。就算只磕一个正确的头，也能积累很大的资粮，清净众多的罪业。不如法的磕头，就算做了成千上万，不仅没有功德，反而有罪过。因为在佛像前随便顶礼，是对佛像有不恭敬的罪业。所以，每一次顶礼都务必要认真地做，才可圆满功德。
